Во первых, если у вас нет среды разработки Eclipse, надо скачать здесь пакет SWT.
Лучше конечно установить себе Eclipse.
В эклипсе библиотека SWT лежит в папке plugins.
Пакет представляет собой архив классов.
Нам понадобится папка org и динамические библиотеки (dll которые). Допустим, у нас имеется папка Game.
В этой папке находится папка src с подпапкой babgamegui и файлом Main.java в ней.
Создадим папку compile в папке Game.
Чтобы скомпилировать java файл нам потребуется ввести следующую команду находясь в папке Game:
javac -cp ./org.eclipse.swt.win32.win32.x86_3.2.1.v3235e_swg20070503.jar; -d ./compile src/babgamegui/Main.java
Название библиотеки естественно зависит от версии Eclipse, так что внимательней.
Теперь в папке compile находятся наши class файлы. Самое интересное, открываем файл org.eclipse.swt.win32.win32.x86_3.2.1.v3235e_swg20070503.jar (он может быть свежее версией или наоборот) архиватором и распаковываем папку org и dll'ки в папку Game.
Создаём Java архив в папке Game.
Напомню, что babgamegui - не просто папка, наш класс находится в пакете, а физически он представляет собой папку. Создаём манифест.
Кстати, по умолчанию, в манифесте нет строки main class (Main-Class:), утилита jar не создаёт её автоматически, если её не попросить об этом специально.
Файл манифеста назовём - manif.
Code
Main-Class: babgamegui.Main
Manifest-Version: 6.6.6
Не забываем опустить каретку на строку ниже после строки Manifest-Version: 6.6.6
Напомню, что конец файла должен быть обозначен символами перевода строки и возврата каретки. (ну это просто Enter нажать в конце последней строки, если кто не в курсе) Пишем в командной строке jar cmf manif Main.jar * создаётся файл Main.jar
Можете открыть его архиватором и посмотреть, что туда попало. Запуск: java -jar Main.jar
Обязательно в каталоге где происходит запуск наличие динамических библиотек. (они весят немного)
Вообще, можно указать любую папку с dll'ками при помощи параметра java.library.path (пример использования ниже) Без упаковки запуск осуществляется так:
java -cp "./org.eclipse.swt.win32.win32.x86_3.2.1.v3235e_swg20070503.jar";./ -Djava.library.path="./" babgamegui.Main
Динамические библиотеки:
swt-awt-win32-3235.dll
swt-gdip-win32-3235.dll
swt-wgl-win32-3235.dll
swt-win32-3235.dll
По идее нам нужна только последняя, ну да ладно, пусть будут все.
Вот такое запутанное объяснение получилось, если возникнут вопросы, не стесняйтесь, спрашивайте. Что-то типа этого должно быть у вас:
Командные файлы созданы для удобства, но можно и без них.
Я экспериментировал с тремя например.
Папки compile не вижу что-то, видимо удалил после упаковки.
| 
